Endüstriyel alanlarda kullanılan membran filtre çözümlerinden nanofiltrasyon sistemleri aynı zamanda yeraltı suları ve yüzey sularının arındırılması işlemleri için de kullanılır. Özellikle son yıllarda insanların geri dönüşüm konusunda bilinçlenmesi ile sanayilerde geri dönüştürülmüş suların kullanımı hızla artar. Nanofiltrasyon sistemleri yöntemi ters ozmos yöntemi ile ultrafiltrasyon yöntemi arasında kalan bir membran arıtma yöntemidir. Bakteri, organik kalıntı ve virüslerin sudan ayrıştırılması işleminde tercih edilir. Özellikle sulu çözeltilerdeki yabancı maddelerin giderilmesi amacıyla tercih edilen, asimetrik yapıya sahip, basınç sürücülü bir membran ayırma yöntemidir.  Ayrıca demineralizasyon, desalinasyon, KOI giderimi ve atık su geri dönüşümü amacıyla birçok farklı endüstride tercih edilmektedir. Az enerji harcayarak çok fazla ayrıştırma yapabilen nanofiltrasyon sistemleri sayesinde ihtiyaç duyulandan fazla ayrıştırma işlemini çok az enerji harcayarak gerçekleştirir.

Bu sebeple endüstriler tarafından çokça tercih edilir.  Nanofiltrasyon sistemleri membranları, çalışma prensibi olarak ters ozmos yöntemine benzese de aralarındaki tek fark uygulanan basıncın bar farkıdır. Nanofiltrasyon sistemlerinde membran gözenek boyutu 0.5-2 nm arasında değişmektedir.